Институт специализируется на разработке средств защиты информации от акустической сигнальной и гидроакустической разведок, а также на разработке инструментов обеспечения безопасности предприятий в условиях повышенной химической, радиационной и экологической опасности. Институт является структурой, подведомственной Федеральной службе по экспортному и техническому контролю (ФСТЭК России).
В своей работе ученые института применяют самые современные технические средства, в том числе кластерные системы. В связи с ростом числа научно-исследовательских проектов возникла необходимость наращивания мощности корпоративного вычислительного комплекса. Эта задача была решена внедрением в инфраструктуру НИИПА дополнительных серверов с общей пиковой производительностью 2,65 Тфлопс. В результате на предприятии создана технологическая база для наиболее перспективных научно-практических исследований по ключевым направлениям деятельности института. Работы по данному проекту вела компания «Т-Платформы».
